When modules are removed from CPAN distributions, latest version of distribution that contains
this module remains indexed. There are several problems with it:
-
It takes space not only on CPAN mirrors, but on minicpan mirrors too.
-
It is tested by cpantesters, so even if problem like hanging module is fixed in newer version,
it still causes problems. Also reports for these versions take space in cpantesters DB.
-
When doing mass upgrade, older version may replace newer version.
If you don't want to delete some old version, you can release new version that includes empty
versions of removed modules.
Note: Sometimes this tool incorrectly detects latest version as old version. Please check before deleting.
I can help you in resolving this issue, my e-mail is alexchorny@gmail.com.
Distribution: BioPerl latest version: 1.7.8
| Dist version | dist | modules indexed |
|---|
| 1.7.7 | CJFIELDS/BioPerl-1.7.7.tar.gz |
Bio::SeqIO::interpro
|
| 1.007002 | CJFIELDS/BioPerl-1.007002.tar.gz |
Bio::Assembly::Contig
Bio::Assembly::ContigAnalysis
Bio::Assembly::IO
Bio::Assembly::IO::ace
Bio::Assembly::IO::bowtie
Bio::Assembly::IO::maq
Bio::Assembly::IO::phrap
Bio::Assembly::IO::sam
Bio::Assembly::IO::tigr
Bio::Assembly::Scaffold
Bio::Assembly::ScaffoldI
Bio::Assembly::Singlet
Bio::Assembly::Tools::ContigSpectrum
Bio::DB::CUTG
Bio::DB::Expression
Bio::DB::Expression::geo
Bio::DB::HIV
Bio::DB::HIV::HIVAnnotProcessor
Bio::DB::HIV::HIVQueryHelper
Bio::DB::MeSH
Bio::DB::Query::HIVQuery
Bio::DB::SeqVersion
Bio::DB::SeqVersion::gi
Bio::DB::Universal
Bio::Factory::MapFactoryI
Bio::LiveSeq::AARange
Bio::LiveSeq::Chain
Bio::LiveSeq::ChainI
Bio::LiveSeq::DNA
Bio::LiveSeq::Exon
Bio::LiveSeq::Gene
Bio::LiveSeq::Intron
Bio::LiveSeq::IO::BioPerl
Bio::LiveSeq::IO::Loader
Bio::LiveSeq::Mutation
Bio::LiveSeq::Mutator
Bio::LiveSeq::Prim_Transcript
Bio::LiveSeq::Range
Bio::LiveSeq::Repeat_Region
Bio::LiveSeq::Repeat_Unit
Bio::LiveSeq::SeqI
Bio::LiveSeq::Transcript
Bio::LiveSeq::Translation
Bio::Map::Clone
Bio::Map::Contig
Bio::Map::CytoMap
Bio::Map::CytoMarker
Bio::Map::CytoPosition
Bio::Map::EntityI
Bio::Map::FPCMarker
Bio::Map::Gene
Bio::Map::GeneMap
Bio::Map::GenePosition
Bio::Map::GeneRelative
Bio::Map::LinkageMap
Bio::Map::LinkagePosition
Bio::Map::MapI
Bio::Map::Mappable
Bio::Map::MappableI
Bio::Map::Marker
Bio::Map::MarkerI
Bio::Map::Microsatellite
Bio::Map::OrderedPosition
Bio::Map::OrderedPositionWithDistance
Bio::Map::Physical
Bio::Map::Position
Bio::Map::PositionHandler
Bio::Map::PositionHandlerI
Bio::Map::PositionI
Bio::Map::PositionWithSequence
Bio::Map::Prediction
Bio::Map::Relative
Bio::Map::RelativeI
Bio::Map::SimpleMap
Bio::Map::TranscriptionFactor
Bio::MapIO
Bio::MapIO::fpc
Bio::MapIO::mapmaker
Bio::MolEvol::CodonModel
Bio::Phenotype::Correlate
Bio::Phenotype::Measure
Bio::Phenotype::MeSH::Term
Bio::Phenotype::MeSH::Twig
Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry
Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry
Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant
Bio::Phenotype::OMIM::OMIMparser
Bio::Phenotype::Phenotype
Bio::Phenotype::PhenotypeI
Bio::PopGen::Genotype
Bio::PopGen::GenotypeI
Bio::PopGen::HtSNP
Bio::PopGen::Individual
Bio::PopGen::IndividualI
Bio::PopGen::IO
Bio::PopGen::IO::csv
Bio::PopGen::IO::hapmap
Bio::PopGen::IO::phase
Bio::PopGen::IO::prettybase
Bio::PopGen::Marker
Bio::PopGen::MarkerI
Bio::PopGen::PopStats
Bio::PopGen::Population
Bio::PopGen::PopulationI
Bio::PopGen::Simulation::Coalescent
Bio::PopGen::Simulation::GeneticDrift
Bio::PopGen::Statistics
Bio::PopGen::TagHaplotype
Bio::PopGen::Utilities
Bio::Restriction::Analysis
Bio::Restriction::Enzyme
Bio::Restriction::Enzyme::MultiCut
Bio::Restriction::Enzyme::MultiSite
Bio::Restriction::EnzymeCollection
Bio::Restriction::EnzymeI
Bio::Restriction::IO
Bio::Restriction::IO::bairoch
Bio::Restriction::IO::base
Bio::Restriction::IO::itype2
Bio::Restriction::IO::prototype
Bio::Restriction::IO::withrefm
Bio::Root::Build
Bio::SearchDist
Bio::SeqEvolution::DNAPoint
Bio::SeqEvolution::EvolutionI
Bio::SeqEvolution::Factory
Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo
Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair
Bio::SeqIO::abi
Bio::SeqIO::agave
Bio::SeqIO::alf
Bio::SeqIO::chadoxml
Bio::SeqIO::chaos
Bio::SeqIO::chaosxml
Bio::SeqIO::ctf
Bio::SeqIO::exp
Bio::SeqIO::flybase_chadoxml
Bio::SeqIO::lasergene
Bio::SeqIO::pln
Bio::SeqIO::strider
Bio::SeqIO::ztr
Bio::Structure::Atom
Bio::Structure::Chain
Bio::Structure::Entry
Bio::Structure::IO
Bio::Structure::IO::pdb
Bio::Structure::Model
Bio::Structure::Residue
Bio::Structure::SecStr::DSSP::Res
Bio::Structure::SecStr::STRIDE::Res
Bio::Structure::StructureI
Bio::Taxonomy
Bio::Taxonomy::FactoryI
Bio::Taxonomy::Node
Bio::Taxonomy::Taxon
Bio::Taxonomy::Tree
Bio::Tools::AlignFactory
Bio::Tools::Analysis::DNA::ESEfinder
Bio::Tools::Analysis::Protein::Domcut
Bio::Tools::Analysis::Protein::ELM
Bio::Tools::Analysis::Protein::GOR4
Bio::Tools::Analysis::Protein::HNN
Bio::Tools::Analysis::Protein::NetPhos
Bio::Tools::Analysis::Protein::Scansite
Bio::Tools::Analysis::Protein::Sopma
Bio::Tools::dpAlign
Bio::Tools::Phylo::Gumby
Bio::Tools::Protparam
Bio::Tools::pSW
Bio::Tools::SiRNA
Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::saigo
Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::tuschl
Bio::Tree::AlleleNode
|
| 1.6.924 | CJFIELDS/BioPerl-1.6.924.tar.gz |
Bio::DB::SeqHound
Bio::SearchIO::Writer::BSMLResultWriter
Bio::Tools::Analysis::Protein::Mitoprot
Bio::Tools::ERPIN
Bio::Tools::Infernal
Bio::Tools::RNAMotif
|
Distribution: BioPerl-Run latest version: 1.007003
| Dist version | dist | modules indexed |
|---|
| 1.007002 | CJFIELDS/BioPerl-Run-1.007002.tar.gz |
Bio::Installer::EMBOSS
Bio::Installer::Generic
Bio::Installer::Hyphy
Bio::Installer::Muscle
Bio::Installer::Probcons
Bio::Installer::SLR
Bio::Tools::Run::AssemblerBase
Bio::Tools::Run::Bowtie
Bio::Tools::Run::Bowtie::Config
Bio::Tools::Run::BWA
Bio::Tools::Run::BWA::Config
Bio::Tools::Run::Cap3
Bio::Tools::Run::Maq
Bio::Tools::Run::Maq::Config
Bio::Tools::Run::Meme
Bio::Tools::Run::Minimo
Bio::Tools::Run::Newbler
Bio::Tools::Run::Phrap
Bio::Tools::Run::Phylo::Gumby
Bio::Tools::Run::TigrAssembler
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